Entre finales de 1922 y principios de 1923 un grupo de amigos capitaneado por José Bermeosolo ponen en marcha el proyecto de la Sociedad Deportiva Gernika Club.
Así el día 21 de Enero de 1923 en una asamblea convocada en el Liceo de Gernika la idea se materializa quedando establecida la sede social en el bar Iruña.
Rodrigo Luengo y Angel Pertica dan forma al escudo del club, también se establece la indumenraria oficial que será camiseta blanca con escudo del club, calzón negro y medias negras ribeteadas de blanco.
Sin embargo a pesar del entusiasmo de los gernikeses devido a la escasez de medios de la epoca y por la falta de un terreno de juego, el club desaparece en 1933.
Tras la guerra civil Luis Dominguez y Cecilio Soria toman el relevo, en esta epoca el campo de futbol Zubikoa acogío al Gernika Club durante doce años.
El primer título llego en la temporada 1946/47 proclamandose el Gernika campeón de liga de la categoría regional.
Mas tarde el 21 de Noviembre de 1954 se inaugura el campo de fútbol de Santa Lucia en Lurgorri que ha sido durante decadas escenario de triunfos como la Copa Vizcaya en 1958; el ascenso a categoría Regional Preferente en 1971 y el salto a la Tercera División en 1974 año de las bodas de oro del club.
En 1984 el club se traslada al campo de arena de Urbieta durante las obras de reparación y mejora del drenaje del campo. Esta instalación será en el futuro la ubicación definitiva del club.
En la temporada 1993/94 se logra el ascenso a la Segunda División B.
En el año 2005 el club se traslada definitivamente a su actual ubicación, el nuevo campo de Urbieta, levantado sobre el antiguo campo de arena.
El nuevo campo así como las instalaciones adyacentes son de hierba artificial con unos servicios modernos adecuados a la práctica del deporte, este nuevo campo cuenta con un aforo aproximado de 1.500 personas.
En la actualidad el club milita en el grupo IV de la Tercera División con unos resultados muy aceptables y la convicción de volver a ascender al grupo B de la división de plata.